האקדמית תל אביב יפו משלבת בהצלחה רמת לימודים אקדמיים גבוהה ובלתי מתפשרת ויחס אישי ופתוח על מנת לאפשר לכל סטודנט למצות את יכולותיו. מסלול ייחודי באקדמית תל אביב יפו הינו לימודי תואר שני במדעי המחשב בצירוף חטיבה בביואינפורמטיקה.
לימודי מדעי המחשב וביואינפורמטיקה באקדמית תל אביב יפו מיועדים לבוגרי לימודי תואר ראשון בביולוגיה ומדעי המחשב, המעוניינים בתואר שני במדעי המחשב. תוכנית לימודי תואר שני במדעי המחשב כוללת את החידושים האחרונים ואת ההתפתחויות בתחום הטכנולוגיה והיישומים, מקנה העמקה בידע התיאורטי אשר נרכש במהלך לימודי התואר הראשון והרחבה של נושאי ידע נוספים, ומאפשרת להתעדכן ולהרחיב את היכולות המקצועיות של הסטודנט.
החלק הראשון בלימודי מדעי המחשב וביואינפורמטיקה לתואר שני באקדמית תל אביב יפו כולל השלמת קורסים חסרים בתחומי מדעי המחשב, כאשר רק לאחר השלמת חלק זה הסטודנטים יוכלו להמשיך בלימודי מדעי המחשב וביואינפורמטיקה לתואר שני במסלול הרגיל. השלב הראשון אורך שלושה סמסטרים, ומקנה את הידע הבסיס הדרוש מבוגרים במדעי המחשב בקורסים מואצים וייחודיים למסלול זה. על מנת להמשיך לשלב השני בלימודי מדעי המחשב וביואינפורמטיקה, יש לסיים שלב זה בממוצע של 70 לפחות. שלב זה כולל קורסים דוגמת מבני נתונים, מתמטיקה בדידה, מערכות הפעלה, מבנה וארכיטקטורת המחשבים, ועוד. השלב השני בלימודי מדעי המחשב וביואינפורמטיקה לתואר שני באקדמית תל אביב יפו אורך שנתיים, וכולל נושאים דוגמת אלגוריתמים בביולוגיה מולקולארית ואבולוציה מולקולארית.
לימודי תואר ראשון במדעי המחשב וביואינפורמטיקה באקדמית תל אביב יפו מקנים לסטודנטים יתרונות רבים. מלבד רמה אקדמית גבוהה ובלתי מתפשרת, הסטודנטים נהנים מיחס אישי ותמיכה, סגל אקדמי איכותי ובעל ניסיון, תוכניות לימוד עדכניות, ושילוב ייחודי בין ידע אקדמאי והתנסות מעשית. בנוסף, מתקני הלימוד באקדמית תל אביב יפו נוחים במיוחד, כיתות הלימוד קטנות, וישנו מערך כלכלי של תמיכה וסיוע בצורך מלגות ומענקים שונים, וכן שכר לימוד אקדמאי.