מכון אליה הינו מוסד ללימודי מקצועות ההלכה, ברמה גבוהה ועל מנת לשלב בין לימודי מקצוע מעשי ולימודים תורניים. לימודי קורס שיפוץ בתי תפילין במכון אליה הינם בהנחיית ובפיקוח הרבנות הראשית בישראל, ומקנים תעודה מהמכון באישור הרבנים עם סיום הלימודים בהצלחה.
לימודי שיפוץ בתי תפילין במכון אליה מקנים לסטודנטים ידע הלכתי נרחב וכן מיומנות מעשית מקיפה בתיקון ושיפוץ בתי תפילין, ובכלל זה הכנסת פרשיות, תפירה, צביעה, ועוד. חלק מרכזי נוסף בלימודי שיפוץ בתי תפילין במכון אליה הוא הכנת הציוד הדרוש למקצוע בצורה עצמאית, באופן ידני ועצמאי, על מנת להעביר לסטודנטים את כל סודות המקצוע הייחודיים לתחום.
תוכנית לימודי קורס שיפוץ בתי תפילין במכון אליה עשירה ומקיפה, וכוללת את כל הידע הנחוץ למשפצי בתי תפילין. נושאי הלימוד העיקריים כוללים התקנת תפסני שיעוף ידני, צביעת השין שחור שקוף, צביעה סמיכה, חיתוך השיניים, הכנסת פרשיות, ליטוש משטחי השין, הכנסת רצועות יד- ראש, התקנת תפסני בתים, לימוד טור בית יוסף, ליטוש בינוני, משיחת שמן, משנה ברורה ושולחן ערוך, ליטוש טיטורות, צמצום חגורות העור, התקנת סכינים, יישור חריצים ועוד.
אורכו של קורס לימודי שיפוץ בתי תפילין הוא שישה חודשים, במתכונת של שתי פגישות שבועיות. הלימודים מתקיימים במתכונת של לימודי ערב, ובכך מקנים הזדמנות להסבה מקצועית או השלמת ההשכלה גם לאנשים עובדים. תנאי קבלה ללימודי שיפוץ בתי תפילין כוללים המלצה עדכנית של רב המכיר את המועמד, דוגמת ראש כולל או מרא דאתרא. תנאי קבלה נוסף הוא הסכם תנאי לימוד, ותשלום שכר לימוד, ורכישה בנפרד של ערכת לימוד לתלמיד.
עם סיום לימודי שיפוץ בתי תפילין הסטודנטים נבחנים בצורה מעשית בשיפוץ בתי תפילין. בנוסף, יש לעבור בהצלחה מבחן הלכתי, ולהגיש עבודת גמר. לאחר הצלחה בכל המבחנים, הבוגרים זכאים לקבל תעודה ממכון אליה באישור הרבנים, ורשאים להתחיל לעסוק בתחום שיפוץ בתי תפילין.